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狼穴 | 自然
狼穴 | 自然 - 自由 自然 - 自由 GATK4 GERMLINE VARIANT CALLING 分析流程 GATK4 germline variant calling 分析流程. 通过对基因组高通量测序数据的分析可以从中获取Genome Varient的信息。. 这个 过程被称为Call variant,现在已经有很多成熟的软件和流程来完成这个任务。. 本笔记主要记录了使用 GATK4 软件来分析 Variant的方法。. WOLF CAVE - 羽风木石 Wolf Cave. Nature Beauty Freedom. 文章; 类别; 标签; 关于; Hi, I'm Wolfson Liu. Latest Posts PYTHON 学习笔记: BIOCONDA CHANNEL Python 学习笔记: bioconda channel. Bioconda 是 Conda 这个软件管理包的一个 channel,其主要面对需要生物信息分析软件的用户。. bioconda channel中包含 各种语言写的软件包,不仅限于 python。. 添加 bioconda channel后,安装生物信息软件就只需要使用 conda install就可以方便地
R 学习笔记:转换不同版本的基因组坐标 在利用公共数据做基因组数据分析的时候经常会遇到不同的数据使用的人类基 组版本不同。想要对比就需要对基因组坐标进行转换,通常可以直接利用UCSC LiftOver工具进行转换。 当 需要写程序来自动化的情况下,使用R的 liftOver包就很方便。 安装 liftOver R 学习笔记:生成模拟数据 随机数. R 中有很多按照一定分布生成随机数的函数, 这些函数也有对应的生成概率密度函数等相关函数. 生成随机数的函数往往以 "r" 开头, 后面跟着分布的简写, 也有开头为 "d" 的对应 density 函数, 开头为 "p" 的 probability 函数 和 开头为 "q" 的 quantile 函数. 分布. 狼穴 ~ GIT 存储文件结构 狼穴 ~ GIT BRANCH 命令 PYTHON 学习笔记: PANDAS Python 学习笔记: pandas. Pandas 是 Python 进行数据分析的基础包. R 语言一直作为一门统计分析语言, 在数据分析中扮演着重要的角色, 其所具有的 data.frame, list 等数据结构和向量化的函数使得 R 语言成为一门非常好用的数据分析语言. Python 作为一个通用语言本身并没有 查找鸟类信息的若干网站 世界鸟类数据库 avibase. 世界鸟类数据库 avibase 是在加拿大的一个非商业网站, 主要就是收集和分享世界鸟类信息. 优点: 有详细物种说明, 包含世界鸟类最新的鸟类分类和分布信息. 缺点: 需要一定的英文能力, 且狼穴 | 自然
狼穴 | 自然 - 自由 自然 - 自由 GATK4 GERMLINE VARIANT CALLING 分析流程 GATK4 germline variant calling 分析流程. 通过对基因组高通量测序数据的分析可以从中获取Genome Varient的信息。. 这个 过程被称为Call variant,现在已经有很多成熟的软件和流程来完成这个任务。. 本笔记主要记录了使用 GATK4 软件来分析 Variant的方法。. WOLF CAVE - 羽风木石 Wolf Cave. Nature Beauty Freedom. 文章; 类别; 标签; 关于; Hi, I'm Wolfson Liu. Latest Posts PYTHON 学习笔记: BIOCONDA CHANNEL Python 学习笔记: bioconda channel. Bioconda 是 Conda 这个软件管理包的一个 channel,其主要面对需要生物信息分析软件的用户。. bioconda channel中包含 各种语言写的软件包,不仅限于 python。. 添加 bioconda channel后,安装生物信息软件就只需要使用 conda install就可以方便地
R 学习笔记:转换不同版本的基因组坐标 在利用公共数据做基因组数据分析的时候经常会遇到不同的数据使用的人类基 组版本不同。想要对比就需要对基因组坐标进行转换,通常可以直接利用UCSC LiftOver工具进行转换。 当 需要写程序来自动化的情况下,使用R的 liftOver包就很方便。 安装 liftOver R 学习笔记:生成模拟数据 随机数. R 中有很多按照一定分布生成随机数的函数, 这些函数也有对应的生成概率密度函数等相关函数. 生成随机数的函数往往以 "r" 开头, 后面跟着分布的简写, 也有开头为 "d" 的对应 density 函数, 开头为 "p" 的 probability 函数 和 开头为 "q" 的 quantile 函数. 分布. 狼穴 ~ GIT 存储文件结构 狼穴 ~ GIT BRANCH 命令 PYTHON 学习笔记: PANDAS Python 学习笔记: pandas. Pandas 是 Python 进行数据分析的基础包. R 语言一直作为一门统计分析语言, 在数据分析中扮演着重要的角色, 其所具有的 data.frame, list 等数据结构和向量化的函数使得 R 语言成为一门非常好用的数据分析语言. Python 作为一个通用语言本身并没有 查找鸟类信息的若干网站 世界鸟类数据库 avibase. 世界鸟类数据库 avibase 是在加拿大的一个非商业网站, 主要就是收集和分享世界鸟类信息. 优点: 有详细物种说明, 包含世界鸟类最新的鸟类分类和分布信息. 缺点: 需要一定的英文能力, 且 ABOUT - GITHUB PAGES狼穴.
这个博客叫【狼穴】,在这个博客中,我记录我的一些学习心得,一些生活中的事情。 狼穴历史. 20160216: 主题更换为 pelican-blue.狼穴 | 自然
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孟祥溪的博客:他从事医学影像与核医学的 研究,喜欢观鸟,会很多技术。; DeusExMachina:他是我大学同学,做环 境方面的研究工作。; Blog powered by Pelican, which takes great advantage of Python.Theme Pelican-Blue by @parbhat.Pelican-Blue狼穴 | 自然
狼穴. 自然 - 自由. 文章; 标签; 类别; 关于; 推荐; Categories. 柴米油盐; 胡言乱语 狼穴 ~ GIT BRANCH 命令 复制分支. git branch -c和 git branch -C
是用来复制分支的。 对于参数 -c,其只会在目标不存在的时候进行复制,-C 参数则不管目标是 否存在都会复制。-c -f 可以实现和 -C 相同的效果。. 如我们要把当前的分支复制到名称为 test 的分支,因为之前没有 test 分支, 则可以正常复制。 R 学习笔记:生成模拟数据 r 生成模拟数据. 在处理数据或者建模的时候有时候需要对以有数据进行排列组合, 有的时候需要生成模拟数据, r 中有不少很方便的函数可以使用. 查找鸟类信息的若干网站 查找鸟类名称. 在IOC 世界鸟类名录首页上有这么一句话 "Wisdom begins with putting the right name on a thing", 查了一下可能是老子说的 "有名万物之母", 反正说明了命名的重要性. 在查找图片之前, 我们最先应该确定的就是鸟类名称. 怎么去获得鸟类名称? 怎么去了解鸟类的学名中文名和英文名呢? PYTHON 学习笔记: PANDAS Pandas 是 Python 进行数据分析的基础包. R 语言一直作为一门统计分析语言, 在数据分析中扮演着重要的角色, 其所具有的 data.frame, list 等数据结构和向量化的函数使得 R 语言成为一门非常好用的数据分析语言. 【翻译】本月分子254:纤维素合成酶 CELLULOSE SYNTHASE 原文链接 Molecule of the Month: Cellulose Synthase. 纤维素合成酶 Cellulose Synthase. 植物一个糖一个糖来构建坚韧的纤维素。 PDB条目6wlb包含一个纤维素合成酶的三聚体,此处的排列基于整个莲花形状的电镜照片。 每个亚基合成一条纤维素,这里为淡棕色。 GIT DESCRIBE 显示 TAG 的信息 Git describe 命令. git describe 是根据 tag 信息等产生出阅读友好的指定的分支的信息。. 如我们可以给当前的分支设立一个 tag:WOLF CAVE
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